Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG3

Gcc2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc2Q8CHG3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gcc2Q8CHG3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gcc2Q8CHG3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gcc2Q8CHG3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Gcc2Q8CHG3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gcc2Q8CHG3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gcc2Q8CHG3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Gcc2Q8CHG3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Gcc2Q8CHG3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Gcc2Q8CHG3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Gcc2Q8CHG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Gcc2Q8CHG3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Gcc2Q8CHG3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gcc2Q8CHG3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gcc2Q8CHG3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms