Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Upp2Q8CGR7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp2Q8CGR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp2Q8CGR7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms