Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rp1l1Q8CGM2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rp1l1Q8CGM2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rp1l1Q8CGM2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms