Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm14bQ8CGC4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm14bQ8CGC4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm14bQ8CGC4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm14bQ8CGC4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lsm14bQ8CGC4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lsm14bQ8CGC4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm14bQ8CGC4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm14bQ8CGC4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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