Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hpf1Q8CFE2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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