Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkl1Q8CEQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl1Q8CEQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms