Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nup88Q8CEC0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup88Q8CEC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms