Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc17Q8CE13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc17Q8CE13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc17Q8CE13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc17Q8CE13 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms