Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atad2Q8CDM1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atad2Q8CDM1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atad2Q8CDM1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms