Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc87Q8CDL9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc87Q8CDL9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc87Q8CDL9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc87Q8CDL9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms