Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vcpip1Q8CDG3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vcpip1Q8CDG3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms