Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RybpQ8CCI5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RybpQ8CCI5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RybpQ8CCI5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms