Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms