Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb1Q8CBF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb1Q8CBF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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