Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrip1Q8CBD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nrip1Q8CBD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrip1Q8CBD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip1Q8CBD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms