Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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4930572O03RikQ8C5Y0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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4930572O03RikQ8C5Y0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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4930572O03RikQ8C5Y0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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4930572O03RikQ8C5Y0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930572O03RikQ8C5Y0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
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4930572O03RikQ8C5Y0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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4930572O03RikQ8C5Y0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
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4930572O03RikQ8C5Y0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
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4930572O03RikQ8C5Y0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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4930572O03RikQ8C5Y0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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4930572O03RikQ8C5Y0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930572O03RikQ8C5Y0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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