Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac7Q8C2B3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac7Q8C2B3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac7Q8C2B3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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