Protein–RNA interactions for Protein: Q8C116

Fmo9, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo9Q8C116 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fmo9Q8C116 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fmo9Q8C116 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fmo9Q8C116 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fmo9Q8C116 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1175.5 ms