Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx22Q8C084 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx22Q8C084 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx22Q8C084 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms