Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NkrfQ8BY02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkrfQ8BY02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms