Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfrp1Q8BXL7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfrp1Q8BXL7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms