Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt3Q8BXF8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Actrt3Q8BXF8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt3Q8BXF8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms