Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn17Q8BXA6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn17Q8BXA6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn17Q8BXA6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms