Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slx1bQ8BX32 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Slx1bQ8BX32 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx1bQ8BX32 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slx1bQ8BX32 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms