Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx17Q8BVL3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx17Q8BVL3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx17Q8BVL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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