Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcl3Q8BVF2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms