Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cops7bQ8BV13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops7bQ8BV13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops7bQ8BV13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cops7bQ8BV13 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
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