Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad3Q8BUN5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad3Q8BUN5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad3Q8BUN5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms