Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppfia2Q8BSS9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia2Q8BSS9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia2Q8BSS9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms