Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Efemp1Q8BPB5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efemp1Q8BPB5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms