Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga3Q8BMI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga3Q8BMI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga3Q8BMI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms