Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AtripQ8BMG1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AtripQ8BMG1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms