Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smoc1Q8BLY1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smoc1Q8BLY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smoc1Q8BLY1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smoc1Q8BLY1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smoc1Q8BLY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms