Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms