Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc2Q8BKV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc2Q8BKV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc2Q8BKV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms