Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJI1

Slc6a17, Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a17Q8BJI1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a17Q8BJI1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a17Q8BJI1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a17Q8BJI1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a17Q8BJI1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms