Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHL7

Cdc42se1, CDC42 small effector protein 1, mousemouse

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42se1Q8BHL7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,61□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12,6□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12,58□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC12,58□□□□□ -0,39
Cdc42se1Q8BHL7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12,57□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,57□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,57□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,57□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC12,57□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12,57□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC12,56□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC12,52□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,4
Cdc42se1Q8BHL7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC12,52□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Cdc42se1Q8BHL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
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