Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rnf41Q8BH75 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Rnf41Q8BH75 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf41Q8BH75 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf41Q8BH75 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms