Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim6Q8BGE7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim6Q8BGE7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim6Q8BGE7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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