Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a9Q8BGD6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a9Q8BGD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a9Q8BGD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc38a9Q8BGD6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms