Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl2Q8BG73 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl2Q8BG73 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl2Q8BG73 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms