Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jmjd4Q8BFT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jmjd4Q8BFT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jmjd4Q8BFT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jmjd4Q8BFT6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jmjd4Q8BFT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Jmjd4Q8BFT6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Jmjd4Q8BFT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms