Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChfrQ810L3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChfrQ810L3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChfrQ810L3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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