Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbed4Q80WQ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed4Q80WQ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed4Q80WQ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zbed4Q80WQ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms