Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc12Q80WJ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc12Q80WJ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc12Q80WJ6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms