Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk9Q80W65 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk9Q80W65 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk9Q80W65 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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