Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr2eQ80UW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2eQ80UW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms