Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sestd1Q80UK0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sestd1Q80UK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sestd1Q80UK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms