Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vat1lQ80TB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vat1lQ80TB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vat1lQ80TB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vat1lQ80TB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms