Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2q1Q7TSS2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2q1Q7TSS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2q1Q7TSS2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms